Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms