Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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