Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsnl1P62761 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms