Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pou3f4P62515 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou3f4P62515 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms