Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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