Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps11P62281 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rps11P62281 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps11P62281 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms