Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Vbp1P61759 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Vbp1P61759 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Vbp1P61759 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Vbp1P61759 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Vbp1P61759 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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