Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms