Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ActbP60710 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ActbP60710 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms