Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3bP59470 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3bP59470 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms