Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrnp1P59054 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms