Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NcstnP57716 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NcstnP57716 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcstnP57716 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcstnP57716 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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