Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5bP56480 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms