Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms