Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcanP55066 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcanP55066 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcanP55066 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcanP55066 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcanP55066 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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NcanP55066 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcanP55066 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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