Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms