Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms