Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux1P53564 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cux1P53564 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux1P53564 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux1P53564 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms