Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fgd1P52734 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms