Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp1P52624 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp1P52624 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp1P52624 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms