Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SqleP52019 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SqleP52019 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SqleP52019 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SqleP52019 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SqleP52019 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SqleP52019 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SqleP52019 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms