Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff3P51827 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff3P51827 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms