Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs12P50716 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs12P50716 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms