Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TspoP50637 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TspoP50637 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms