Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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