Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LtbrP50284 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LtbrP50284 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms