Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms