Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LmnaP48678 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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