Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms