Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms