Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx1-2P42580 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms