Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms