Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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