Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtlP38585 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtlP38585 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtlP38585 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtlP38585 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms