Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms