Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddit3P35639 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms