Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms