Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpardP35396 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpardP35396 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpardP35396 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpardP35396 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpardP35396 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpardP35396 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpardP35396 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpardP35396 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PpardP35396 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpardP35396 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpardP35396 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpardP35396 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms