Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr2P35343 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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