Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms