Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htr2cP34968 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr2cP34968 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr2cP34968 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr2cP34968 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms