Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms