Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms