Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms