Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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