Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxraP28700 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxraP28700 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxraP28700 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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