Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa4P28311 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa4P28311 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms