Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms