Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms