Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nfkb1P25799 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms